Dự án được tổ chức lần đầu vào năm 2010 bởi Hiệp hội Tác giả hoạt hình Nhật Bản (JAniCA). Nhóm tác giả hoạt hình nhận được 214,5 triệu yên (khoảng 2,27 triệu US$) từ Cục Văn hóa của chính phủ Nhật Bản, và đã phân bổ nguồn quỹ này đến các xưởng phim để đào tạo tại chỗ các họa sĩ diễn hoạt trẻ trong từng năm. Một trong các nguyên nhân hỗ trợ từ Cục Văn hóa Nhật Bản là lo lắng về việc có nhiều công đoạn sản xuất anime đang được thuê gia công từ các nước bên ngoài Nhật Bản - điều đó dẫn đến sự sụt giảm những cơ hội nâng cao các kỹ thuật hoạt hình bên trong Nhật Bản. Năm 2011, Cục Văn hóa một lần nữa cung cấp nguồn vốn cho JAniCA để chọn lựa nhiều hơn các dự án đào tạo họa sĩ diễn hoạt trẻ dưới các gói ngân quỹ cùng tên.[1][2][3][4]

Tháng 4 năm 2014, Hiệp hội Tác giả hoạt hình Nhật Bản (JAniCA) đã công bố rằng họ không còn tổ chức dự án sáng kiến Dự án Đào tạo Họa sĩ diễn hoạt trẻ. Một thời gian sau đó, Hiệp hội Hoạt hình Nhật Bản (AJA) công bố sẽ nhận quản lý dự án.[5]